Kladogram (Pohon Filogeni)

Bisakah dua spesies yang berbeda saling terkait? Tentu saja mereka bisa. Sebagai contoh, ada banyak spesies yang berbeda dari mamalia, atau salah satu jenis mamalia, seperti tikus. Dan mereka semua saling terkait. Dengan kata lain, seberapa dekat atau seberapa jauh mereka akan terpisah dari nenek moyang yang sama selama evolusi? Menentukan bagaimana spesies yang berbeda evolusi terkait bisa menjadi tugas yang luar biasa.

Filogeni adalah sejarah evolusi kelompok organisme yang saling terkait. Hal ini diwakili oleh pohon filogenetik yang menunjukkan bagaimana spesies terkait satu sama lain melalui nenek moyang yang sama. Sebuah Klade adalah sekelompok organisme yang meliputi leluhur dan semua keturunannya. Ini adalah klasifikasi filogenetik, berdasarkan pada hubungan evolusioner.

Filogenetik merupakan kajian mengenai hubungan evolusi diantara organisme atau gen dari unit taksonomi, dipelajari menggunakan kombinasi antara biologi, molekuler dan teknik statistik.

Dasar klasifikasi digunakan dalam sistem filogenetik adalah persamaan dan perbedaan sifat morfologi, anatomi dan molekuler. Sistem tersebut mencerminkan urutan perkembangan serta jauh dekatnya kekerabatan antartakson, selain mencerminkan persamaan dan perbedaan sifat berupa morfologi, anatomi. Taksonomi filogenetik merupakan  pengelompokan spesies atau jenis baru dengan cara analisis molekuler dan morfologi.  Klasifikasi sistem filogenetik disusun berdasarkan persamaan fenotip yang mengacu pada sifat-sifat bentuk luar, faal, tingkah laku yang dapat diamati, dan pewarisan keturunan yang mengacu pada hubungan evolusioner jenis nenek moyang hingga cabang-cabang keturunannya.

Filogenetik pemisahan ke dalam hubungan evolusioner (clades), berdasarkan perbandingan genom kemungkinan akan menggantikan phenotypical (phenetic) taksonomi.
Pengelompokan organisme terdiri dari
Phenetic sistem yaitu pengelompokan organisme berdasarkan kesamaan saling fenotipik (fisik dan kimia) karakteristik. Pengelompokan Phenetic mungkin atau tidak mungkin berkorelasi dengan hubungan evolusi.

Filogenetik sistem yaitu pengelompokan organisme didasarkan pada kesamaan warisan evolusi. Teknik sekuensing DNA dan RNA dianggap memberikan filogeni paling berarti terutama untuk menentukan nenek moyang dan evolusi yang terjadi.

Tujuan dari sistematika yaitu untuk menciptakan suatu klasifikasi yang mencerminkan sejarah evolusi organisme.
Untuk melakukan hal tersebut, diperlukan pengelompokan spesies ke dalam taksa :
1. Monofiletik yaitu jika nenek moyang tunggalnya hanya menghasilkan semua spesies turunan dalam takson tersebut dan bukan spesies pada takson lain.
2. Polifiletik yaitu jika anggotanya diturunkan dari dua atau lebih bentuk nenek moyang yang tidak sama bagi semua anggotanya.
3. Parafiletik yaitu jika takson itu tidak meliputi spesies yang memiliki nenek moyang yang sama yang menurunkan spesies yang termasuk dalam takson tersebut.

Monofiletik, polifiletik dan parafiletik di ilustrasikan dalam sebagai berikut:
a. Monofiletik
Takson 1 yang terdiri dari tujuh spesies, memenuhi kualifikasi sebagai suatu pengelompokan monofiletik, yang merupakan bentuk ideal dalam taksonomi. Takson tersebut meliputi semua spesies terutama dan juga nenek moyang bersama yang paling dekat (spesies B).
b. Polifiletik
Takson 2 suatu subkelompok di dalam takson 1 adalah polifiletik (spesies E dan G) diturunkan dari dua nenek moyang yang paling dekat (spesies C dan F).
c. Parafiletik
Takson 3 adalah parafiletik, spesies A dimasukan tanpa menggabungkan semua keturunan dari nenek moyang tersebut.

Contoh tumbuhan berbunga atau Spermatophyta adalah kelompok terbesar tumbuhan yang hidup di data-data molekular, mendapati bahwa monokotil merupakan kelompok monofiletik atau Tumbuhan paku (atau paku-pakuan, Pteridophyta atau Filicophyta), adalah satu divisio dengan empat kelas monofiletik: Psilotopsida, mencakup Ophioglossales.

Contoh lain adalah pengelompokkan berbagai monofiletik, terdapat kelompok besar dikotil yang monofiletik yang dinamai, sebagai contoh misalnya : Oryza sativa (padi), Zea mays (jagung), dan Musa paradisiaca. Kelompok semacam itu dikatakan sebagai kelompok monofiletik, yang dapat digambarkan. Kajian di atas membuktikan bahwa monokots adalah monofiletik dan dikot adalah parafiletik. Satu contoh lain adalah zaitun (Olea europaea).


inset picture

Kladogram ini mengklasifikasikan mamalia, reptil, dan burung-burung pada Klade didasarkan pada hubungan evolusioner mereka.


insert picture

Linnaeus mengklasifikasikan organisme berdasarkan ciri-ciri fisik yang jelas. Pada dasarnya, organisme dikelompokkan bersama-sama jika mereka tampak sama. Setelah Darwin menerbitkan teori evolusi pada 1800-an, para ilmuwan mencari cara untuk mengklasifikasikan organisme yang menunjukkan filogeni. Filogeni adalah sejarah evolusi dari kelompok organisme yang terkait. Hal ini diwakili oleh pohon filogenetik, seperti pada Gambar di bawah
ini.



Salah satu cara untuk mengklasifikasikan organisme yang menunjukkan filogeni adalah dengan menggunakan yang disebut dengan klade. Klade adalah sekelompok organisme yang meliputi leluhur dan semua keturunannya. Klade didasarkan pada kladistika. Ini adalah metode membandingkan ciri-ciri spesies terkait untuk menentukan hubungan leluhur dan keturunannya.
Pohon filogenetik. Pohon filogenetik ini menunjukkan bagaimana tiga spesies hipotetis terkait satu sama lain melalui nenek moyang yang sama. Apakah Anda melihat mengapa Spesies 1 dan 2 lebih erat terkait satu sama lain daripada Spesies 2 dan 3?
Klade diwakili oleh kladogram, seperti pada Gambar di bawah ini. Kladogram ini merupakan klade mamalia dan reptil. Klade Reptil termasuk burung. Hal ini menunjukkan bahwa burung berevolusi dari reptil. Linnaeus mengklasifikasikan mamalia, reptil, dan burung-burung di kelas yang terpisah. Ini menutupu hubungan evolusi mereka.